Nueva métrica de similitud para la comparación de conjuntos de tamaños dispares con aplicación en farmacogenómica.
M. J. Rivas Lopez, J. M. Sánchez-Santos, A. Berral-González, M. M. Arroyo, J. De las Rivas Sanz
El estudio de redes farmacogenómicas basadas en genes diana compartidos es vital, pues muchos fármacos oncológicos carecen de caracterización completa de sus dianas génicas, lo que restringe sus aplicaciones clínicas.
Proponemos una nueva similitud, el Índice-B, que es mayor que las métricas tradicionales cuando se comparan dos conjuntos, uno de ellos mucho más grande que el otro. Traducido a conjuntos de genes diana, este índice refleja mejor que el solapamiento de genes es más significativo si uno de los conjuntos es muy pequeño, por la poca probabilidad de que un gen concreto esté en el conjunto pequeño.
Para demostrar su utilidad, evaluamos las interacciones entre 124 fármacos oncológicos y 399 genes relacionados con el cáncer, probando que proporciona una alternativa a las métricas convencionales, y puede usarse tanto para validar perfiles farmacológicos conocidos como para descubrir nuevas asociaciones gen-diana que permitan el reposicionamiento de fármacos oncológicos.
Palabras clave: Similitud de conjuntos. Clustering. Farmacogenómica.
Programado
Sesión de pósters II
4 de septiembre de 2026 09:00
Facultade de Ciencias Económicas e Empresariais
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